Продукты гниения органических веществ (сероводород, аммиак, нитриты и нитраты) очень вредны для рыб.
Присутствие сероводорода в аквариуме определяется по появлению неприятного запаха тухлых яиц и помутнению воды.
Симптомами отравления аммиаком является потемнение окраски тела, нарушение координации движений, попытки рыб выпрыгнуть из аквариума.
Концентрация аммиака и аммония возрастает при снижении времени аэрации и повышении pH. Отравления можно избежать частой сменой воды (1/5 части еженедельно), уменьшением плотности посадки и снижением рациона кормления.
При отравлении нитратами бледнеют жабры, наступает удушье, рыбы становятся вялыми. Рекомендуется чаще менять воду, не добавлять соль, повысить pH до 8,0, добавив столовой соды (0,5—1,0 чайной ложки на 100 л воды).
При отравлении нитритами жабры и кровь рыб становятся коричневыми. Лечение заключается во внесении в воду метиленовой сини (3—4 мг/л) и поваренной соли (2 г/л).